DESCRIPCIÓN GENERAL:La técnica emergente de ADN ambiental (eDNA) esta actualmente revolucionando la manera en la que estudiamos y analizamos los ecosistemas. La técnica cuenta con multitud de aplicaciones en el estudio de comunidades biológicas tanto en la investigacion fundamental como aplicada, por ejemplo para la gestión y conservación de los ecosistemas. En el proyecto AQUABAR se abordará el uso de eDNA para realizar la caracterización de comunidades biológicas desde el punto de vista de los análisis de biodiversidad, abundancia de los organismos e indicadores ecológicos.
El objetivo del proyecto es ampliar el conocimiento sobre la aplicación de la técnica de ADN ambiental para la caracterizacion de comunidades biologicas y poder reducir las actuales incertidumbres que existen respecto a la estimacion de biodiversidad, al cálculo de biomasa de organismos a partir de la concentración de ADN y al uso de esta técnica para estimar índices de calidad ecológicos. Asi mismo el proyecto generará una librería genética con especies de eucariotas y procariotas de la Cordillera Cantábrica.
El candidato realizará una revisión bibiográfica sobre el uso de eDNA para la estimación de biodiversidad, biomasa y para el cálculo de estado ecológico en ríos a partir de marcadores (primers) generales y específicos. Realizará tambien un trabajo de optimización e implementación de herramientas, scripts y códigos específicos para realizar analísis bioinformatico y estadístico de secuencias de ADN. Recibirá y realizara tambien formación en técnicas de secuenciación. Como resultado final participará y elaborará informes, articulos cientificos asi como presentaciones en congresos.
Trabajarás en el grupo de Ecosistemas Continentales dirigido por el Profesor Jose Barquín codo con codo con otros compañeros que desarrollan su actividad generando nuevo conocimiento en otros aspectos de la ecología y el funcionamiento de los ecosistemas fluviales.